Hoy es día de limpieza en la escuela de primaria, y la liga juvenil de detectives se encuentra haciendo sus tareas cuando Mitsuhiko aparece muy nervioso diciendo que una niña de otra clase ha desaparecido. Cuando comenta que esta niña se parecía mucho a Haibara, Conan y Ai se temen lo peor. ¿Y si la organización la ha confundido con Haibara y la han secuestrado?