Lupin begint aan de diefstal van een onlangs ontdekte Japanse cultuurschat die naar Duitsland is vervoerd. Tijdens zijn poging tot overval is hij echter getuige van de vermeende 'dood' van Zenigata, een plan bedacht door een ninja clan die ook op zoek is naar de schat. Kunnen Lupin en zijn vrienden voorkomen dat de ninja clan krijgt wat ze zoeken?