Cette saison se sépare en deux arcs : Les 5 guerriers de la Lune ont perdu la mémoire depuis leur dernier combat, mais Luna sera obligé de réveillé les guerrières afin d'empêcher Ali et En, deux extraterrestres de voler l'énergie des humains, ceci voulant sauver leur arbre ancestrale grâce à elle. Dans le second arc, Usagi accueille chez elle Chibiusa, une cousine éloigné dont elle ne connaissait pas l'existence, très vite Usagi comprendra que la petite fille est poursuivi par des ennemis venant du Royaume de la Lune Noir. Mais Pourquoi ? et qu'elle est le secret de la jeune fille ?